Theo Sở Tài nguyên và Môi trường (TN&MT) Cà Mau, toàn tỉnh có 29 nhà máy chế biến thuỷ sản của 23 doanh nghiệp với tổng công suất 147.589 tấn/năm. Hầu hết số nhà máy này tập trung tại TP.Cà Mau. Nhiều nhà máy cùng với các đại lý thu mua, sơ chế tôm nguyên liệu ven sông Gành Hào (Cà Mau) xả nước thải không qua xử lý gây ô nhiễm dòng sông.

Hiện nay trên địa bàn Cà Mau chỉ có 30% các nhà máy chế biến thuỷ sản đảm bảo về mặt môi trường. Theo đoàn kiểm tra của các tỉnh Bạc Liêu, Cà Mau, Sóc Trăng, việc đầu tư cho hệ thống xử lý môi trường rất tốn kém, chính vì vậy nhiều nhà máy cam kết nhưng không thực hiện. Trong đó, nhiều nhà máy có nhưng không đảm bảo kỹ thuật. Một số nhà máy có đầu tư hệ thống xử lý nhưng chỉ hoạt động khi có đoàn kiểm tra, nên việc lập biên bản xử phạt rất khó khăn.

 Tại Cà Mau, Cty Camimex đầu tư hệ thống xử lý nước thải trên 5 tỉ đồng, nhưng thường xuyên đóng cửa, có đoàn kiểm tra mới cho vận hành.

Nước thải tại các nhà máy chế biến thuỷ sản xả ra sông rạch là thực trạng đáng báo động. Bởi nguồn nước này len lỏi đến các vuông tôm sẽ gây ô nhiễm nguồn nước ảnh hưởng đến sức khoẻ và sản xuất của người dân.

Tại Công trình Khí - điện - đạm Cà Mau, Công ty Môi trường Thanh Tân đã nhận thầu toàn bộ rác thải trên công trường. Thế nhưng đối với rác thải có giá, nhà thầu đưa đi bán, số rác còn lại đưa đốt lộ thiên, gây ô nhiễm.